Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms