Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cab39Q06138 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cab39Q06138 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms