Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thbs3Q05895 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms