Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sox12Q04890 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms