Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Smpd1Q04519 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd1Q04519 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd1Q04519 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd1Q04519 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd1Q04519 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.9 ms