Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnb1Q03717 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms