Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tff2Q03404 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms