Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfiaQ02780 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfiaQ02780 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms