Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GscQ02591 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GscQ02591 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GscQ02591 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GscQ02591 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GscQ02591 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GscQ02591 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GscQ02591 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GscQ02591 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GscQ02591 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GscQ02591 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GscQ02591 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GscQ02591 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GscQ02591 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GscQ02591 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GscQ02591 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GscQ02591 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GscQ02591 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GscQ02591 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GscQ02591 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GscQ02591 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GscQ02591 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GscQ02591 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GscQ02591 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GscQ02591 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GscQ02591 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GscQ02591 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GscQ02591 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GscQ02591 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GscQ02591 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GscQ02591 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GscQ02591 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GscQ02591 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GscQ02591 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GscQ02591 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GscQ02591 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GscQ02591 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GscQ02591 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GscQ02591 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GscQ02591 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GscQ02591 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GscQ02591 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GscQ02591 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GscQ02591 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GscQ02591 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GscQ02591 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GscQ02591 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GscQ02591 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GscQ02591 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GscQ02591 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GscQ02591 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GscQ02591 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GscQ02591 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GscQ02591 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GscQ02591 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GscQ02591 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GscQ02591 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GscQ02591 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GscQ02591 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GscQ02591 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GscQ02591 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GscQ02591 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GscQ02591 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GscQ02591 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GscQ02591 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GscQ02591 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GscQ02591 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GscQ02591 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GscQ02591 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GscQ02591 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GscQ02591 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GscQ02591 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GscQ02591 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GscQ02591 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GscQ02591 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GscQ02591 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GscQ02591 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GscQ02591 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GscQ02591 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GscQ02591 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GscQ02591 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GscQ02591 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GscQ02591 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GscQ02591 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GscQ02591 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GscQ02591 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GscQ02591 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GscQ02591 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GscQ02591 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GscQ02591 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GscQ02591 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GscQ02591 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GscQ02591 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GscQ02591 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GscQ02591 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GscQ02591 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GscQ02591 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GscQ02591 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GscQ02591 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GscQ02591 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms