Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snai1Q02085 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms