Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme2Q01768 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms