Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mc1rQ01727 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms