Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gja5Q01231 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gja5Q01231 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms