Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms