Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms