Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GabpaQ00422 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms