Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lama4P97927 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lama4P97927 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lama4P97927 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lama4P97927 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lama4P97927 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Lama4P97927 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lama4P97927 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lama4P97927 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lama4P97927 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lama4P97927 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Lama4P97927 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lama4P97927 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lama4P97927 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lama4P97927 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lama4P97927 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lama4P97927 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms