Protein–RNA interactions for Protein: P97861

Krt86, Keratin, type II cuticular Hb6, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt86P97861 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt86P97861 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt86P97861 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt86P97861 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt86P97861 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt86P97861 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt86P97861 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt86P97861 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms