Protein–RNA interactions for Protein: P97470

Ppp4c, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4cP97470 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp4cP97470 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp4cP97470 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp4cP97470 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp4cP97470 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp4cP97470 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp4cP97470 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp4cP97470 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp4cP97470 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4cP97470 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4cP97470 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4cP97470 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4cP97470 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4cP97470 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4cP97470 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4cP97470 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4cP97470 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp4cP97470 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms