Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smyd1P97443 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms