Protein–RNA interactions for Protein: P97433

Arhgef28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef28P97433 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Arhgef28P97433 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Arhgef28P97433 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Arhgef28P97433 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Arhgef28P97433 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Arhgef28P97433 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Arhgef28P97433 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Arhgef28P97433 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Arhgef28P97433 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Arhgef28P97433 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Arhgef28P97433 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Arhgef28P97433 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Arhgef28P97433 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Arhgef28P97433 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Arhgef28P97433 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Arhgef28P97433 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Arhgef28P97433 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Arhgef28P97433 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Arhgef28P97433 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Arhgef28P97433 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms