Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nbr1P97432 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms