Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabpb2P81069 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabpb2P81069 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms