Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptprn2P80560 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptprn2P80560 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptprn2P80560 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptprn2P80560 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptprn2P80560 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptprn2P80560 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptprn2P80560 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptprn2P80560 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptprn2P80560 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptprn2P80560 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptprn2P80560 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptprn2P80560 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Ptprn2P80560 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptprn2P80560 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Ptprn2P80560 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Ptprn2P80560 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Ptprn2P80560 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Ptprn2P80560 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptprn2P80560 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptprn2P80560 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Ptprn2P80560 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptprn2P80560 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptprn2P80560 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Ptprn2P80560 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptprn2P80560 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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Ptprn2P80560 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Ptprn2P80560 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Ptprn2P80560 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptprn2P80560 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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