Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf3P70671 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf3P70671 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf3P70671 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf3P70671 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf3P70671 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf3P70671 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf3P70671 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf3P70671 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms