Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

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Length 650 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sparcl1P70663 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sparcl1P70663 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sparcl1P70663 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sparcl1P70663 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sparcl1P70663 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sparcl1P70663 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sparcl1P70663 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sparcl1P70663 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sparcl1P70663 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sparcl1P70663 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sparcl1P70663 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sparcl1P70663 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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