Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tp53bp1P70399 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tp53bp1P70399 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tp53bp1P70399 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tp53bp1P70399 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tp53bp1P70399 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tp53bp1P70399 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tp53bp1P70399 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tp53bp1P70399 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tp53bp1P70399 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tp53bp1P70399 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tp53bp1P70399 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tp53bp1P70399 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tp53bp1P70399 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tp53bp1P70399 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tp53bp1P70399 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tp53bp1P70399 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tp53bp1P70399 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tp53bp1P70399 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tp53bp1P70399 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tp53bp1P70399 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tp53bp1P70399 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms