Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rad50P70388 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad50P70388 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad50P70388 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad50P70388 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad50P70388 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad50P70388 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rad50P70388 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rad50P70388 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad50P70388 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad50P70388 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad50P70388 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms