Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp3P70281 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms