Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vamp7P70280 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vamp7P70280 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vamp7P70280 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp7P70280 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp7P70280 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp7P70280 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp7P70280 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp7P70280 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp7P70280 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp7P70280 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp7P70280 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp7P70280 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp7P70280 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp7P70280 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp7P70280 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp7P70280 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp7P70280 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp7P70280 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp7P70280 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp7P70280 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp7P70280 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp7P70280 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp7P70280 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp7P70280 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp7P70280 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp7P70280 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp7P70280 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp7P70280 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp7P70280 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp7P70280 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp7P70280 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vamp7P70280 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vamp7P70280 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Vamp7P70280 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vamp7P70280 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vamp7P70280 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vamp7P70280 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vamp7P70280 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp7P70280 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp7P70280 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp7P70280 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp7P70280 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp7P70280 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp7P70280 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp7P70280 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp7P70280 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp7P70280 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp7P70280 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp7P70280 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp7P70280 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp7P70280 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp7P70280 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp7P70280 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vamp7P70280 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp7P70280 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp7P70280 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp7P70280 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp7P70280 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp7P70280 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp7P70280 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vamp7P70280 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp7P70280 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp7P70280 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp7P70280 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp7P70280 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp7P70280 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp7P70280 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms