Protein–RNA interactions for Protein: P63268

Actg2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg2P63268 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actg2P63268 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actg2P63268 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actg2P63268 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actg2P63268 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actg2P63268 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actg2P63268 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Actg2P63268 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg2P63268 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg2P63268 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg2P63268 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg2P63268 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actg2P63268 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg2P63268 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms