Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp2P63044 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms