Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp3P63024 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms