Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uba52P62984 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uba52P62984 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uba52P62984 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uba52P62984 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uba52P62984 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uba52P62984 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uba52P62984 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uba52P62984 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uba52P62984 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uba52P62984 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uba52P62984 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uba52P62984 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uba52P62984 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uba52P62984 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uba52P62984 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uba52P62984 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uba52P62984 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba52P62984 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba52P62984 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba52P62984 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba52P62984 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba52P62984 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba52P62984 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba52P62984 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba52P62984 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba52P62984 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uba52P62984 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uba52P62984 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms