Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ElobP62869 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ElobP62869 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ElobP62869 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ElobP62869 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ElobP62869 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ElobP62869 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ElobP62869 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ElobP62869 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ElobP62869 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ElobP62869 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ElobP62869 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ElobP62869 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ElobP62869 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ElobP62869 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ElobP62869 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ElobP62869 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ElobP62869 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ElobP62869 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ElobP62869 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ElobP62869 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ElobP62869 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ElobP62869 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ElobP62869 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ElobP62869 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ElobP62869 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ElobP62869 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ElobP62869 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ElobP62869 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ElobP62869 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ElobP62869 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ElobP62869 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ElobP62869 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ElobP62869 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ElobP62869 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ElobP62869 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ElobP62869 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ElobP62869 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ElobP62869 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ElobP62869 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ElobP62869 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElobP62869 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElobP62869 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElobP62869 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElobP62869 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElobP62869 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ElobP62869 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElobP62869 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElobP62869 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElobP62869 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElobP62869 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElobP62869 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElobP62869 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElobP62869 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElobP62869 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElobP62869 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElobP62869 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElobP62869 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElobP62869 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElobP62869 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElobP62869 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElobP62869 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ElobP62869 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElobP62869 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElobP62869 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElobP62869 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElobP62869 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElobP62869 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElobP62869 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElobP62869 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElobP62869 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElobP62869 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElobP62869 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElobP62869 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElobP62869 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElobP62869 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElobP62869 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElobP62869 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElobP62869 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ElobP62869 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ElobP62869 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ElobP62869 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ElobP62869 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ElobP62869 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ElobP62869 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ElobP62869 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElobP62869 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElobP62869 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElobP62869 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElobP62869 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElobP62869 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElobP62869 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElobP62869 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElobP62869 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElobP62869 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElobP62869 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElobP62869 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElobP62869 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElobP62869 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElobP62869 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms