Protein–RNA interactions for Protein: P62754

Rps6, 40S ribosomal protein S6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6P62754 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6P62754 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6P62754 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6P62754 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6P62754 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6P62754 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6P62754 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6P62754 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rps6P62754 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6P62754 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6P62754 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6P62754 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6P62754 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6P62754 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6P62754 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6P62754 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6P62754 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6P62754 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6P62754 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6P62754 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6P62754 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6P62754 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6P62754 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6P62754 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6P62754 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6P62754 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6P62754 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6P62754 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6P62754 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms