Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acta2P62737 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acta2P62737 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta2P62737 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta2P62737 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acta2P62737 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta2P62737 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms