Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrpd1P62315 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms