Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpeP62305 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpeP62305 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms