Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps29P62274 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps29P62274 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps29P62274 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps29P62274 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps29P62274 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
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