Protein–RNA interactions for Protein: P62196

Psmc5, 26S proteasome regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc5P62196 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmc5P62196 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Psmc5P62196 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms