Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vbp1P61759 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vbp1P61759 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms