Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcbp1P60335 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcbp1P60335 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms