Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Nphp4P59240 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Nphp4P59240 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Nphp4P59240 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nphp4P59240 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nphp4P59240 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Nphp4P59240 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Nphp4P59240 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nphp4P59240 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.56■■■□□ 2
Nphp4P59240 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nphp4P59240 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nphp4P59240 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nphp4P59240 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nphp4P59240 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nphp4P59240 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nphp4P59240 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Nphp4P59240 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nphp4P59240 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Nphp4P59240 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nphp4P59240 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nphp4P59240 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nphp4P59240 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nphp4P59240 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nphp4P59240 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nphp4P59240 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nphp4P59240 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nphp4P59240 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nphp4P59240 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nphp4P59240 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nphp4P59240 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Nphp4P59240 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nphp4P59240 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nphp4P59240 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nphp4P59240 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Nphp4P59240 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Nphp4P59240 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Nphp4P59240 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms