Protein–RNA interactions for Protein: P59113

Fermt1, Fermitin family homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt1P59113 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fermt1P59113 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fermt1P59113 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fermt1P59113 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fermt1P59113 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fermt1P59113 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fermt1P59113 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fermt1P59113 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fermt1P59113 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fermt1P59113 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fermt1P59113 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fermt1P59113 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fermt1P59113 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fermt1P59113 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fermt1P59113 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fermt1P59113 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fermt1P59113 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fermt1P59113 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fermt1P59113 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fermt1P59113 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fermt1P59113 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fermt1P59113 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fermt1P59113 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fermt1P59113 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fermt1P59113 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fermt1P59113 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fermt1P59113 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fermt1P59113 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fermt1P59113 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fermt1P59113 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fermt1P59113 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Fermt1P59113 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fermt1P59113 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms