Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm2P58774 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm2P58774 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms