Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Strn4P58404 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Strn4P58404 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Strn4P58404 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Strn4P58404 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Strn4P58404 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Strn4P58404 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Strn4P58404 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Strn4P58404 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Strn4P58404 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Strn4P58404 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Strn4P58404 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Strn4P58404 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms