Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Smpdl3bP58242 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms