Protein–RNA interactions for Protein: P57791

Rce1, CAAX prenyl protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rce1P57791 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rce1P57791 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rce1P57791 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rce1P57791 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rce1P57791 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rce1P57791 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rce1P57791 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rce1P57791 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms