Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CtnsP57757 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CtnsP57757 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CtnsP57757 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CtnsP57757 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CtnsP57757 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtnsP57757 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtnsP57757 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtnsP57757 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtnsP57757 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtnsP57757 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtnsP57757 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtnsP57757 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CtnsP57757 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CtnsP57757 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtnsP57757 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtnsP57757 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtnsP57757 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CtnsP57757 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms